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　コレラは病原性のコレラ菌が経口感染することにより引き起こされる急性の下痢症です。発展途上国を中心として世界中で猛威をふるっており、毎年130～400万人が感染し、2.1～14.3万人が亡くなっています。

　コレラ菌はコレラ毒素をコードする遺伝子を持ったCTXファージがVibrio choleraeという細菌に感染し、溶原化する（細菌のゲノムにファージのゲノムが組み込まれる）ことにより生じます。歴史上、コレラは7回のパンデミックを起こしていますが、第6次までのパンデミックを起こしていたコレラ菌はCTXファージを放出することができませんでした。しかし、現在継続している第7次パンデミックのコレラ菌はCTXファージを放出できることが特徴として知られていました。そのため、第7次パンデミックでは、コレラ菌がヒトからヒトへ直接伝播する糞口経路に加え、コレラの流行によりCTXファージが放出され、環境中で新たなコレラ菌が発生するルートが加わったと考えられています。

　本研究では、インドのコレラ患者から分離したコレラ菌の完全ゲノム配列（完全に繋がったゲノム配列）を解析することにより、近年の流行株はゲノム中で繰り返し配列の並びに変化があり、これによりCTXファージゲノムの複製能力を失ったことを発見しました。データベース上のコレラ菌完全ゲノムを調べたところ、このようなタイプの株は2007年にインドで初めて確認されましたが、2009年以降はカリブ海のハイチ、アフリカのコンゴ、アジアのタイなど、世界中でこのタイプの株に替わっていました。これらの結果は、現在継続しているパンデミックでは、2010年頃から伝播様式が変化し、糞口経路に限定されていることを示しています。

【発表雑誌】
■ 雑誌名：mSphere（2021年6月9日［米国東部時間］）
■ 論文タイトル：Recent Vibrio cholerae O1 epidemic strains are unable to replicate CTXΦ prophage genome
■ 著者：Kaoru Ochi, Tamaki Mizuno, Prosenjit Samanta, Asish Mukhopadhyay, Shin-ichi Miyoshi, and Daisuke Imamura